Add debug files to cleaning process

src/cluster/Makefile

@@ -24,6 +24,8 @@ F_CLU_OBJS=$(OBJDIR)/clu.o $(OBJDIR)/edfb_clu.o
 #CXX_CLU_OBJS=$(OBJDIR)/np_cluster.o $(OBJDIR)/Commons.o $(OBJDIR)/Configuration.o $(OBJDIR)/file_io.o $(OBJDIR)/Parsers.o $(OBJDIR)/sph_subs.o $(OBJDIR)/clu_subs.o $(OBJDIR)/cluster.o $(OBJDIR)/TransitionMatrix.o
 CXX_CLU_OBJS=$(OBJDIR)/np_cluster.o $(OBJDIR)/cluster.o $(LIBNPTM)
 
+CXX_CLU_DEBUG=$(OBJDIR)/np_cluster.g* $(OBJDIR)/cluster.g*
+
 
 all: $(LIBNPTM) $(BUILDDIR_CLU)/clu $(BUILDDIR_CLU)/edfb_clu $(BUILDDIR_CLU)/np_cluster
 
@@ -47,8 +49,8 @@ $(BUILDDIR_CLU)/np_cluster: $(OBJDIR) $(CXX_CLU_OBJS) $(BUILDDIR_CLU) $(LIBNPTM)
 	$(CXX) $(CXXFLAGS) -o $(BUILDDIR_CLU)/np_cluster $(CXX_CLU_OBJS) $(LIBNPTM) $(CXXLDFLAGS) 
 
 clean:
-	rm -f $(F_CLU_OBJS) $(CXX_CLU_OBJS)
+	rm -f $(F_CLU_OBJS) $(CXX_CLU_OBJS) $(CXX_CLU_DEBUG)
 
 wipe:
-	rm -f $(BUILDDIR_CLU)/clu $(BUILDDIR_CLU)/edfb_clu $(BUILDDIR_CLU)/np_cluster $(F_CLU_OBJS) $(CXX_CLU_OBJS)
+	rm -f $(BUILDDIR_CLU)/clu $(BUILDDIR_CLU)/edfb_clu $(BUILDDIR_CLU)/np_cluster $(F_CLU_OBJS) $(CXX_CLU_OBJS) $(CXX_CLU_DEBUG)
 

src/libnptm/Makefile

@@ -23,6 +23,7 @@ CXX_NPTM_OBJS=$(OBJDIR)/Commons.o $(OBJDIR)/Configuration.o $(OBJDIR)/file_io.o
 
 CXX_NPTM_DYNOBJS=$(DYNOBJDIR)/Commons.o $(DYNOBJDIR)/Configuration.o $(DYNOBJDIR)/file_io.o $(DYNOBJDIR)/Parsers.o $(DYNOBJDIR)/sph_subs.o $(DYNOBJDIR)/clu_subs.o $(DYNOBJDIR)/tfrfme.o $(DYNOBJDIR)/tra_subs.o $(DYNOBJDIR)/TransitionMatrix.o
 
+CXX_NPTM_DEBUG=$(OBJDIR)/Commons.g* $(OBJDIR)/Configuration.g* $(OBJDIR)/file_io.g* $(OBJDIR)/Parsers.g* $(OBJDIR)/sph_subs.g* $(OBJDIR)/clu_subs.g* $(OBJDIR)/tfrfme.g* $(OBJDIR)/tra_subs.g* $(OBJDIR)/TransitionMatrix.g*
 
 all: $(BUILDDIR_NPTM)/libnptm.a $(BUILDDIR_NPTM)/libnptm.so
 
@@ -42,10 +43,9 @@ $(BUILDDIR_NPTM)/libnptm.so: $(BUILDDIR_NPTM) $(DYNOBJDIR) $(CXX_NPTM_DYNOBJS)
 	$(CXX) $(CXXFLAGS) $(PICFLAGS) $(SOFLAGS) -o $(BUILDDIR_NPTM)/libnptm.so $(CXX_NPTM_DYNOBJS)
 
 clean:
-	rm -f $(CXX_NPTM_OBJS) $(CXX_NPTM_DYNOBJS)
+	rm -f $(CXX_NPTM_OBJS) $(CXX_NPTM_DYNOBJS) $(CXX_NPTM_DEBUG)
 
 wipe:
 	#echo "BUILDDIR_NPTM in libnptm is $(BUILDDIR_NPTM)"
 	#echo "LIBNPTM in libnptm is $(LIBNPTM)"
-	rm -f $(BUILDDIR_NPTM)/libnptm.a $(BUILDDIR_NPTM)/libnptm.so $(CXX_NPTM_OBJS) $(CXX_NPTM_DYNOBJS)
-
+	rm -f $(BUILDDIR_NPTM)/libnptm.a $(BUILDDIR_NPTM)/libnptm.so $(CXX_NPTM_OBJS) $(CXX_NPTM_DYNOBJS) $(CXX_NPTM_DEBUG)

src/sphere/Makefile

@@ -24,6 +24,8 @@ F_SPH_OBJS=$(OBJDIR)/edfb_sph.o $(OBJDIR)/sph.o
 #CXX_SPH_OBJS=$(OBJDIR)/np_sphere.o $(OBJDIR)/Commons.o $(OBJDIR)/Configuration.o $(OBJDIR)/file_io.o $(OBJDIR)/Parsers.o $(OBJDIR)/sph_subs.o $(OBJDIR)/sphere.o $(OBJDIR)/TransitionMatrix.o
 CXX_SPH_OBJS=$(OBJDIR)/np_sphere.o $(OBJDIR)/sphere.o
 
+CXX_SPH_DEBUG=$(OBJDIR)/np_sphere.g* $(OBJDIR)/sphere.g*
+
 all: $(LIBNPTM) $(BUILDDIR_SPH)/edfb_sph $(BUILDDIR_SPH)/sph $(BUILDDIR_SPH)/np_sphere
 
 $(OBJDIR):
@@ -46,8 +48,8 @@ $(BUILDDIR_SPH)/np_sphere: $(OBJDIR) $(CXX_SPH_OBJS) $(BUILDDIR_SPH) $(LIBNPTM)
 	$(CXX) $(CXXFLAGS) -o $(BUILDDIR_SPH)/np_sphere $(CXX_SPH_OBJS) $(LIBNPTM) $(CXXLDFLAGS) 
 
 clean:
-	rm -f $(F_SPH_OBJS) $(CXX_SPH_OBJS)
+	rm -f $(F_SPH_OBJS) $(CXX_SPH_OBJS) $(CXX_SPH_DEBUG)
 
 wipe:
-	rm -f $(BUILDDIR_SPH)/edfb_sph $(BUILDDIR_SPH)/sph $(BUILDDIR_SPH)/np_sphere $(F_SPH_OBJS) $(CXX_SPH_OBJS)
+	rm -f $(BUILDDIR_SPH)/edfb_sph $(BUILDDIR_SPH)/sph $(BUILDDIR_SPH)/np_sphere $(F_SPH_OBJS) $(CXX_SPH_OBJS) $(CXX_SPH_DEBUG)
 

src/testing/Makefile

@@ -21,7 +21,9 @@ include ../make.inc
 
 CXX_TEDF_OBJS=$(OBJDIR)/test_TEDF.o 
 
-CXX_TTMS_OBJS=$(OBJDIR)/test_TTMS.o 
+CXX_TTMS_OBJS=$(OBJDIR)/test_TTMS.o
+
+CXX_TESTING_DEBUG=$(OBJDIR)/test_TEDF.g* $(OBJDIR)/test_TTMS.g*
 
 all: $(LIBNPTM) $(BUILDDIR_TEST)/test_TEDF $(BUILDDIR_TEST)/test_TTMS
 
@@ -43,7 +45,7 @@ $(BUILDDIR_TEST)/test_TTMS: $(OBJDIR) $(CXX_TTMS_OBJS) $(BUILDDIR_TEST) $(LIBNPT
 	$(CXX) $(CXXFLAGS) -o $(BUILDDIR_TEST)/test_TTMS $(CXX_TTMS_OBJS) $(LIBNPTM) $(CXXLDFLAGS) 
 
 clean:
-	rm -f $(CXX_TEDF_OBJS) $(CXX_TTMS_OBJS)
+	rm -f $(CXX_TEDF_OBJS) $(CXX_TTMS_OBJS) $(CXX_TESTING_DEBUG)
 
 wipe:
-	rm -f $(BUILDDIR_TEST)/test_TEDF $(BUILDDIR_TEST)/test_TTMS $(CXX_TEDF_OBJS) $(CXX_TTMS_OBJS)
+	rm -f $(BUILDDIR_TEST)/test_TEDF $(BUILDDIR_TEST)/test_TTMS $(CXX_TEDF_OBJS) $(CXX_TTMS_OBJS) $(CXX_TESTING_DEBUG)

src/trapping/Makefile

@@ -23,6 +23,8 @@ F_TRAP_OBJS=$(OBJDIR)/frfme.o $(OBJDIR)/lffft.o
 
 CXX_TRAP_OBJS=$(OBJDIR)/np_trapping.o $(OBJDIR)/cfrfme.o $(OBJDIR)/clffft.o
 
+CXX_TRAP_DEBUG=$(OBJDIR)/np_trapping.g* $(OBJDIR)/cfrfme.g* $(OBJDIR)/clffft.g*
+
 all: $(LIBNPTM) $(BUILDDIR_TRA)/frfme $(BUILDDIR_TRA)/lffft $(BUILDDIR_TRA)/np_trapping
 
 $(OBJDIR):
@@ -45,8 +47,8 @@ $(BUILDDIR_TRA)/np_trapping: $(OBJDIR) $(CXX_TRAP_OBJS) $(BUILDDIR_TRA) $(LIBNPT
 	$(CXX) $(CXXFLAGS) -o $(BUILDDIR_TRA)/np_trapping $(CXX_TRAP_OBJS) $(LIBNPTM) $(CXXLDFLAGS) 
 
 clean:
-	rm -f $(F_TRAP_OBJS) $(CXX_TRAP_OBJS)
+	rm -f $(F_TRAP_OBJS) $(CXX_TRAP_OBJS) $(CXX_TRAP_DEBUG)
 
 wipe:
-	rm -f $(BUILDDIR_TRA)/frfme $(BUILDDIR_TRA)/lffft $(BUILDDIR_TRA)/np_trapping $(F_TRAP_OBJS) $(CXX_TRAP_OBJS)
+	rm -f $(BUILDDIR_TRA)/frfme $(BUILDDIR_TRA)/lffft $(BUILDDIR_TRA)/np_trapping $(F_TRAP_OBJS) $(CXX_TRAP_OBJS) $(CXX_TRAP_DEBUG)